Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms