Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 QKI-212ENST00000541696 1097 ntTSL 28.4□□□□□ -1.063e-40■■■■■ 142
UTP3Q9NQZ2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.499e-7■■■■■ 142
UTP3Q9NQZ2 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 212.77□□□□□ -0.374e-13■■■■■ 141.9
UTP3Q9NQZ2 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 519.1■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 PMP22-208ENST00000580584 428 ntTSL 316.57■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 416.51■□□□□ 0.233e-9■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 PMP22-204ENST00000426385 571 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 GATA2-206ENST00000498200 563 ntTSL 219.53■□□□□ 0.729e-8■■■■■ 141.8
UTP3Q9NQZ2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.186e-7■■■■■ 141.7
UTP3Q9NQZ2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.776e-7■■■■■ 141.7
UTP3Q9NQZ2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 141.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.124e-7■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF274-201ENST00000326804 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.061e-10■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.355e-10■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.111e-10■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 CCAR2-211ENST00000522599 1107 ntTSL 514.5□□□□□ -0.095e-10■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-10■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.255e-10■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 YARS-202ENST00000466052 728 ntTSL 311.43□□□□□ -0.583e-26■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 YARS-204ENST00000470377 782 ntTSL 38.28□□□□□ -1.083e-26■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC2-208ENST00000520746 497 ntTSL 37.6□□□□□ -1.191e-10■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC2-215ENST00000523334 4810 ntTSL 24.24□□□□□ -1.731e-10■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 IDUA-208ENST00000509948 796 ntTSL 321.98■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 IDUA-209ENST00000514192 697 ntTSL 320.61■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 141.6
UTP3Q9NQZ2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.144e-10■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.824e-10■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 LINC01184-208ENST00000514409 494 ntTSL 1 (best)19.12■□□□□ 0.654e-10■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.34e-10■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 BABAM2-202ENST00000344773 1852 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 LINC01184-203ENST00000501652 1601 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.754e-10■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 BTBD7-206ENST00000554644 2891 ntTSL 210.28□□□□□ -0.765e-8■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 CHMP4A-205ENST00000531158 563 ntTSL 49.67□□□□□ -0.865e-8■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 LINC01184-205ENST00000508353 488 ntTSL 38.16□□□□□ -1.14e-10■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 CHMP4A-210ENST00000552620 716 ntTSL 27.48□□□□□ -1.215e-8■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 ILF3-205ENST00000586544 3859 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 141.5
UTP3Q9NQZ2 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 141.4
UTP3Q9NQZ2 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 141.4
UTP3Q9NQZ2 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)7.37□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 141.4
UTP3Q9NQZ2 CLASRP-207ENST00000587112 867 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 141.4
UTP3Q9NQZ2 MTO1-204ENST00000415228 2240 ntTSL 514.74□□□□□ -0.054e-8■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)13.14□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 MTO1-208ENST00000462039 2416 ntTSL 212.46□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 MTO1-203ENST00000370308 2621 ntTSL 1 (best)11.52□□□□□ -0.574e-8■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 MTO1-201ENST00000370300 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.644e-8■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 MTO1-205ENST00000415954 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.654e-8■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.34e-8■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.876e-10■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.016e-10■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.196e-10■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-205ENST00000418258 7815 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.226e-10■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-203ENST00000375274 4720 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.36e-10■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-208ENST00000430669 8232 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.326e-10■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-206ENST00000421141 7659 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.46e-10■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-11■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 LRRD1-202ENST00000422722 3511 ntTSL 212.82□□□□□ -0.362e-11■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.112e-11■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 141.3
UTP3Q9NQZ2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.379e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.969e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.949e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.99e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF8-204ENST00000479933 2120 ntTSL 1 (best)20.47■□□□□ 0.879e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.869e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.799e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 CORO7-226ENST00000575531 2636 ntTSL 215.87■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.099e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 AL080251.1-201ENST00000494072 4369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.369e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 DIS3L2-201ENST00000273009 3201 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 MACC1-203ENST00000471019 304 ntTSL 39.39□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 141.2
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