Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms