Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms