Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1EQ9GZS1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms