Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO3-224ENST00000540848 1574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02262-201ENST00000416680 735 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131097.1-201ENST00000437438 739 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096751.2-201ENST00000507483 792 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
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