Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms