Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CADM1Q9BY67 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms