Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms