Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLVAPQ9BX97 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms