Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK19Q9BWU1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK19Q9BWU1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms