Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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