Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms