Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms