Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms