Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms