Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms