Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TEFMQ96QE5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TEFMQ96QE5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms