Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC38A2Q96QD8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC38A2Q96QD8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC38A2Q96QD8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC38A2Q96QD8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC38A2Q96QD8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC38A2Q96QD8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC38A2Q96QD8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC38A2Q96QD8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC38A2Q96QD8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms