Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms