Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms