Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SENP8Q96LD8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms