Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHDQ96IW2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHDQ96IW2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms