Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms