Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms