Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms