Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HGDQ93099 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HGDQ93099 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HGDQ93099 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HGDQ93099 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HGDQ93099 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HGDQ93099 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HGDQ93099 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HGDQ93099 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HGDQ93099 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HGDQ93099 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms