Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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