Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMYD1Q8NB12 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMYD1Q8NB12 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms