Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms