Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms