Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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