Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms