Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms