Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms