Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OPN5Q6U736 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms