Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms