Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms