Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYSMD4Q5XG99 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms