Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms