Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms