Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms