Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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