Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGHGQ32M88 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGHGQ32M88 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms