Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms