Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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