Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms