Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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