Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ECM1Q16610 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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ECM1Q16610 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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ECM1Q16610 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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ECM1Q16610 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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