Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms